home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Celestin Apprentice 5 / Apprentice-Release5.iso / Source Code / Libraries / DCLAP 6d / dclap6d / SeqPups / seqs / dros-ig.seq < prev    next >
Text File  |  1996-07-05  |  6KB  |  111 lines
  1.  
  2. ;  TOIG of: Dro5s-T.Seq  check: 9487  from: 1  to: 120
  3. ;  
  4. ;  120        Dros. melanogaster 5s rRna
  5. ;     Dro5s-T.Seq  Length: 120  April 6, 1989  21:22  Check: 9487  ..
  6. dro5stseq
  7. GCCAACGACCAUACCACGCUGAAUACAUCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAAUUAAGCAGCGUCGCGGGCG
  8. GUUAGUACUUAGAUGGGGGACCGCUUGGGAACACCGCGUGUUGUUGGCCU1
  9.  
  10. ;  TOIG of: Dro5srna.Seq  check: 9487  from: 1  to: 120
  11. ;  
  12. ;  
  13. ; LOCUS       DRORRA        120 bp ss-rRNA            RNA       04-SEP-1984
  14. ; DEFINITION  D.melanogaster 5S rRNA.
  15. ; ACCESSION   J01854
  16. ; KEYWORDS    5S ribosomal RNA; ribosomal RNA.
  17. ; SOURCE      Drosophila melanogaster (KC cell line, subline F6 [1], [2]) rRNA.
  18. ;   ORGANISM  Drosophila melanogaster
  19. ;             Eukaryota; Metazoa; Arthropoda; Insecta; Diptera.
  20. ; REFERENCE   1  (bases 1 to 120)
  21. ;   AUTHORS   Benhamou,J. and Jordan,B.R.
  22. ;   TITLE     Nucleotide sequence of Drosophila melanogaster 5S RNA: Evidence for
  23. ;             a general 5S RNA model
  24. ;   JOURNAL   FEBS Lett 62, 146-149 (1976)
  25. ;   STANDARD  full staff_review
  26. ; REFERENCE   2  (bases 1 to 120)
  27. ;   AUTHORS   Benhamou,J., Jourdan,R. and Jordan,B.R.
  28. ;   TITLE     Sequence of Drosophila 5S RNA synthesized by cultured cells and by
  29. ;             the insect at different developmental stages: Homogeneity of the
  30. ;             product and homologies with other 5S RNAs at the level of primary
  31. ;             and secondary structure
  32. ;   JOURNAL   J Mol Evol 9, 279-298 (1977)
  33. ;   STANDARD  full staff_review
  34. ; COMMENT     [1] compares given sequence with 5S RNA sequences from chlorella
  35. ;             and human. [2] notes that the sequence appears to be homogeneous
  36. ;             both in the KC cell line and in the insect at different
  37. ;             developmental stages.
  38. ; 
  39. ;             Feature table cross reference is made to Erdmann et al. 'Collection
  40. ;             of published 5S and 5.8S ribosomal RNA sequences' in Nucl Acid Res
  41. ;             11, r105-r133 (1983).
  42. ; FEATURES       from  to/span     description
  43. ;     rRNA          1      120     5S rRNA (NAR: 47)
  44. ;     refnumbr      1        1     numbered 1 in [1], [2]
  45. ;     revision     63       68     cgcggg in [2]; gggcgc in [1]
  46. ; BASE COUNT       26 a     33 c     35 g     26 t
  47. ; ORIGIN      5' end of mature 5S rRNA.
  48. ; 
  49. ;  Drorra.Structural  Length: 120  March 12, 1989  00:35  Check: 9487  ..
  50. dro5srnaseq
  51. GCCAACGACCAUACCACGCUGAAUACAUCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAAUUAAGCAGCGUCGCGGGCG
  52. GUUAGUACUUAGAUGGGGGACCGCUUGGGAACACCGCGUGUUGUUGGCCU1
  53.  
  54. ;  TOIG of: Droest6.Seq  check: 8008  from: 1  to: 1819
  55. ;  
  56. ;  
  57. ; LOCUS       DROEST6      1819 bp ss-mRNA            INV       31-AUG-1987
  58. ; DEFINITION  D.melanogaster esterase-6 mRNA, complete cds.
  59. ; ACCESSION   M15961
  60. ; KEYWORDS    carboxylic-ester hydrolase; esterase 6; serine hydrolase.
  61. ; SOURCE      D.melanogaster (strain Oregon R) 3- to 5-day-old male, cDNA to
  62. ;             mRNA, clone cDm233.
  63. ;   ORGANISM  Drosophila melanogaster
  64. ;             Eukaryota; Metazoa; Arthropoda; Insecta; Diptera.
  65. ; REFERENCE   1  (bases 1 to 1819)
  66. ;   AUTHORS   Oakeshott,J.G., Collet,C., Phillis,R.W., Nielsen,K.M.,
  67. ;             Russell,R.J., Chambers,G.K., Ross,V. and Richmond,R.C.
  68. ;   TITLE     Molecular cloning and characterization of esterase-6, a serine
  69. ;             hydrolase of Drosophila
  70. ;   JOURNAL   Proc Nat Acad Sci USA 84, 3359-3363 (1987)
  71. ;   STANDARD  full staff_review
  72. ; COMMENT     Draft entry and computer-readable sequence for [1] kindly provided
  73. ;             by R.C.Richmond, 12-JUN-1987.
  74. ; FEATURES       from  to/span     description
  75. ;     pept         25     1671     esterase-6 precursor (EC 3.1.1.1)
  76. ;     sigp         25       87     esterase-6 signal peptide
  77. ;     matp         88     1668     esterase-6
  78. ;     mRNA    <     1     1819     Est6 mRNA
  79. ;     refnumbr      1        1     numbered 1 in [1]
  80. ; BASE COUNT      495 a    375 c    467 g    482 t
  81. ; ORIGIN      1 bp upstream of EcoRI site; chromosome BK9 region 69A1.
  82. ; 
  83. ; INVERTEBRATE:DROEST6  Length: 1819  January 9, 1989  16:48  Check: 8008  ..
  84. droest6seq
  85. GAATTCGCCGGAGTGAGGAGCAACATGAACTACGTGGGACTGGGACTTATCATTGTGCTGAGCTGCCTTT
  86. GGCTCGGTTCGAACGCGAGTGATACAGATGACCCTCTGTTGGTGCAGCTGCCCCAGGGCAAGCTACGTGG
  87. TCGCGATAATGGAAGCTACTACAGCTACGAATCGATTCCCTACGCCGAACCGCCCACTGGCGATCTACGA
  88. TTCGAGGCTCCAGAGCCGTACAAACAAAAGTGGTCGGATATATTCGATGCCACCAAAACCCCGGTGGCGT
  89. GCCTGCAGTGGGATCAGTTCACGCCTGGGGCCAACAAATTGGTAGGAGAGGAGGATTGCCTAACCGTCAG
  90. CGTCTACAAGCCGAAGAATAGCAAGAGGAATAGCTTTCCGGTGGTGGCCCACATTCACGGAGGTGCCTTT
  91. ATGTTCGGTGCAGCATGGCAAAATGGACACGAGAACGTGATGCGTGAGGGCAAATTCATTCTGGTGAAGA
  92. TAAGCTATCGCCTGGGGCCATTGGGTTTCGTGAGCACCGGCGATAGGGATCTTCCCGGAAACTATGGACT
  93. GAAAGATCAACGGCTGGCTCTCAAATGGATTAAGCAGAATATAGCCAGTTTTGGTGGAGAACCGCAGAAC
  94. GTACTGTTGGTTGGTCACTCCGCTGGAGGAGCTTCGGTCCATCTGCAGATGCTTCGTGAAGATTTCGGCC
  95. AGCTGGCCAGGGCGGCATTCTCGTTTAGTGGAAATGCTCTAGATCCATGGGTTATACAGAAGGGAGCAAG
  96. AGGACGAGCCTTTGAACTGGGACGCAACGTGGGATGTGAATCGGCTGAAGACTCGACCAGCCTGAAGAAA
  97. TGCCTAAAGTCAAAGCCAGCCAGTGAATTAGTCACCGCCGTCCGTAAATTCCTTATATTTTCCTATGTGC
  98. CCTTTGCTCCATTTAGTCCTGTATTGGAGCCATCGGATGCTCCAGACGCCATTATCACCCAGGATCCCAG
  99. GGATGTCATTAAGAGCGGAAAGTTCGGACAGGTTCCGTGGGCTGTTTCCTATGTCACAGAGGATGGTGGC
  100. TACAATGCCGCCTTGCTTTTGAAGGAACGGAAATCTGGAATAGTTATCGATGATCTAAACGAGCGTTGGC
  101. TTGAGTTGGCACCATATTTACTATTCTACCGGGACACGAAGACCAAAAAGGATATGGACGACTACTCGCG
  102. GAAAATTAAGCAGGAGTATATAGGCAATCAGAGATTTGACATCGAAAGCTATTCAGAATTGCAGCGGCTA
  103. TTCACGGATATTCTCTTCAAGAATAGCACGCAGGAGTCATTGGATCTTCATCGCAAATATGGAAAGAGTC
  104. CTGCCTACGCTTATGTCTATGACAATCCAGCCGAAAAAGGAATCGCACAGGTCCTGGCCAATCGAACCGA
  105. TTATGATTTTGGAACTGTACACGGTGACGACTACTTTTTGATATTCGAAAATTTCGTACGAGATGTGGAA
  106. ATGCGTCCGGATGAGCAGATAATTTCGAGAAATTTTATCAATATGCTGGCAGATTTTGCTTCGAGTGATA
  107. ATGGCTCTCTAAAATATGGTGAATGCGATTTCAAAGATAGTGTAGGTAGTGAGAAATTCCAATTATTAGC
  108. TATTTATATTGATGCTGCCAGAATAGGCAGCATGTGGAATTTCCGTAAGTTACATGAATAAAATCAAAAA
  109. TTTTTCGTTCTGTGTAATTTTTAATTATTTAATTATTCTCAACTGGCTTTAAATATCATTTGTACAAAAC
  110. GTGTTTGTCGCTTTATATTTTGGTTTTTGTTGTTTCTTTATAAAGAATAATAAACGTTTGTTTACCCGC1
  111.